1、選題
國家自然科學基金的定位是“支持基礎研究，堅持自由探索，發(fā)揮導向作用”，作為基礎研究，需要關注和應用最新研究成果，但決不可趕時髦：研究的熱點固然重要，更需要關注科學前沿，強調“新”。
客觀的說，農口相當一部分申請是應用基礎研究，除了原創(chuàng)性研究外，會有一些在生命科學研究的基礎上，根據中國特色，開展相應的深入研究的項目，這樣的申請必須說明特色所在和對我國農業(yè)、環(huán)境的重要性以及深入研究的不可替代性。應用基礎研究的申請書要避免寫成技術性項目，純粹應用某種技術解決什么問題不是基金支持的方向。
科學基金的申請原則之一是“有所為，有所不為”，但有些申請書的題目過大，研究內容包羅萬象，面面俱到，沒有找準重點。至于項目組并沒有什么前期積累或者相關基礎，僅僅根據項目的重要性申請立項更是不行的。那么選題我們應該注意些什么呢？
①要切記選題不能夠太寬泛，最終確定的選題應集中回答1-2個重要科學問題，不能貪多貪大。
②熱點的課題不一定就更好一些，爭議太大的議題，發(fā)表的文獻就多，那么新穎性就會相對下降，而且如果碰到評審和你的態(tài)度相反，那就不太好了。
③臨床課題研究最好不要選擇臨床應用方向，偏應用基礎研究在國自然的基金申請中更受青睞。
④選題追求的結果需要切合實際，預期的結果是走很多步才能達到的話，會缺少許多的基礎理論，預計踏踏實實的走一步比沒有基礎走很遠會更有說服力。
⑤多學科交叉一直是中國自然科學基金委所鼓勵的，如果有多學科交叉，一般會比較受人青睞，特別是在青年基金的申請中。但是一定要符合自身實際，不能為了學科交叉而強行進行交叉。
2、立項依據
至少應該有3個方面：項目的重要性，國內外相關研究的最新進展和工作基礎。首先，需要論證的是所申請項目的重要性，而不是該領域（例如糧食安全）的重要性;不能簡單的以國外或者國內沒有做過的研究就作為立項依據，需要深刻的分析論證開展該研究的重要性和緊迫性。
其次，科學的發(fā)展突飛猛進，3年以前的文獻不能反映當前的科學前沿!但是有不少申請引用的文獻都是2005年以前的，并不了解最近1、2年國內外相關領域的最新進展，根本不能說明擬開展的研究現在進展到什么程度或者是否已經解決，使研究項目是否值得立項成了大問題。有一些申請書僅僅引用項目組最近的文章，但這還是不夠的，應該引用權威刊物最近2年的文獻。特別需要指出的是一些申請書有意無意的回避（不提）直接相關的研究最新進展，貌似新穎，實際上將適得其反。
第三，需要點出科學問題和立項的基礎，說明用什么新的思路探索，做什么，怎么做，項目組有什么相關的積累。所謂“學術思想新穎，技術路線可行”之類的話，不是申請人自己吹的，而是要靠對項目的深刻理解和獨到的視角體現出來的。
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